2006年1月26日，美国FDA批准索坦治疗胃肠间质瘤。主要基于一项索坦治疗胃肠间质瘤的临床试验：索坦明显延长了胃肠间质瘤患者的无进展生存期和延长总生存期。伊马替尼治疗失败后，改用索坦组疾病无进展生存期为5.6个月，而安慰剂组为1.4个月。

在伊马替尼抵抗或无法耐受的胃肠道间质瘤（GIST）患者中，初步研究显示：循环中KIT水平可能是TTP的一个标记，可溶性KIT（sKIT）水平的降低可能预示着伊马替尼和索坦治疗有效。研究中期分析显示，索坦组与安慰剂组相比TTP显著延长，中位TTP为27.3周对6.4周（HR=0.33,P<0.0001）索坦持续每日给药似乎是伊马替尼抵抗或无法耐受的GIST患者的一个安全且有效的给药策略。

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